Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab17P35292 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab17P35292 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab17P35292 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms