Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxa10P31310 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms