Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja4P28235 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gja4P28235 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gja4P28235 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gja4P28235 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gja4P28235 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms