Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdk11bP24788 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cdk11bP24788 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms