Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rag1P15919 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms