Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoa4P06728 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoa4P06728 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms