Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnk4O88454 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnk4O88454 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms