Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SfnO70456 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SfnO70456 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SfnO70456 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SfnO70456 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SfnO70456 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SfnO70456 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SfnO70456 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SfnO70456 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SfnO70456 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SfnO70456 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SfnO70456 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SfnO70456 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SfnO70456 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SfnO70456 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SfnO70456 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SfnO70456 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SfnO70456 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms