Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nptx2O70340 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Nptx2O70340 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms