Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ldb2O55203 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ldb2O55203 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms