Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sap18O55128 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sap18O55128 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sap18O55128 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sap18O55128 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sap18O55128 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sap18O55128 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sap18O55128 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sap18O55128 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sap18O55128 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Sap18O55128 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sap18O55128 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms