Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DffaO54786 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DffaO54786 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DffaO54786 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DffaO54786 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DffaO54786 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DffaO54786 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DffaO54786 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DffaO54786 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DffaO54786 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DffaO54786 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DffaO54786 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DffaO54786 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DffaO54786 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DffaO54786 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DffaO54786 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DffaO54786 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DffaO54786 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DffaO54786 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms