Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gp1baO35930 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms