Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Klf9O35739 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Klf9O35739 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Klf9O35739 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Klf9O35739 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Klf9O35739 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Klf9O35739 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf9O35739 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Klf9O35739 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms