Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ppfibp2O35711 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ppfibp2O35711 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms