Protein–RNA interactions for Protein: O35621

Pmm1, Phosphomannomutase 1, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmm1O35621 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pmm1O35621 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms