Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-ObO35424 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-ObO35424 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms