Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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Abcc1O35379 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Abcc1O35379 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Abcc1O35379 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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