Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Capn1O35350 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn1O35350 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn1O35350 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn1O35350 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn1O35350 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn1O35350 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn1O35350 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn1O35350 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn1O35350 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn1O35350 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn1O35350 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn1O35350 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn1O35350 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn1O35350 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Capn1O35350 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Capn1O35350 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Capn1O35350 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Capn1O35350 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Capn1O35350 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn1O35350 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn1O35350 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn1O35350 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn1O35350 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn1O35350 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn1O35350 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn1O35350 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Capn1O35350 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Capn1O35350 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn1O35350 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn1O35350 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn1O35350 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn1O35350 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn1O35350 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn1O35350 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn1O35350 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn1O35350 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn1O35350 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn1O35350 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn1O35350 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn1O35350 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn1O35350 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Capn1O35350 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn1O35350 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Capn1O35350 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms