Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scarb2O35114 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Scarb2O35114 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Scarb2O35114 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scarb2O35114 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms