Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm3542K7N6U2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gm3542K7N6U2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3542K7N6U2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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