Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm5294J3QP53 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Gm5294J3QP53 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5294J3QP53 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5294J3QP53 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5294J3QP53 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5294J3QP53 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5294J3QP53 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm5294J3QP53 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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