Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smim22J3QP37 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms