Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

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Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm19965J3QNY8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm19965J3QNY8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm19965J3QNY8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm19965J3QNY8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm19965J3QNY8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm19965J3QNY8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Gm19965J3QNY8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm19965J3QNY8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
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Gm19965J3QNY8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm19965J3QNY8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm19965J3QNY8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm19965J3QNY8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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