Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn34c2J3QNM1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34c2J3QNM1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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