Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3415J3QMS8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3415J3QMS8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3415J3QMS8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3415J3QMS8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm3415J3QMS8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm3415J3QMS8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm3415J3QMS8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm3415J3QMS8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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