Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Gm20830J3KML6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Gm20830J3KML6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms