Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ercc6F8VPZ5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ercc6F8VPZ5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc6F8VPZ5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms