Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm10477F6SW83 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm10477F6SW83 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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