Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Herc6F2Z461 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Herc6F2Z461 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms