Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
4930579F01RikE9Q3L6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
4930579F01RikE9Q3L6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms