Protein–RNA interactions for Protein: E9PW10

Triml2, Tripartite motif family-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml2E9PW10 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Triml2E9PW10 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Triml2E9PW10 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Triml2E9PW10 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Triml2E9PW10 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Triml2E9PW10 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Triml2E9PW10 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms