Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc8D3YZV8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc8D3YZV8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms