Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pnldc1B2RXZ1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pnldc1B2RXZ1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms