Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc22a28B2RT89 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc22a28B2RT89 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms