Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxb8B1AY40 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms