Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
4930435E12RikA6X8Z9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms