Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3173A6NAS3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3173A6NAS3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms