Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatsperbA2RTF1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms