Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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