Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lrit3W8DXL4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lrit3W8DXL4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lrit3W8DXL4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lrit3W8DXL4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lrit3W8DXL4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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