Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gm28036V9GXJ1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm28036V9GXJ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gm28036V9GXJ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gm28036V9GXJ1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Gm28036V9GXJ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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