Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Hdac5Q9Z2V6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Hdac5Q9Z2V6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Hdac5Q9Z2V6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Hdac5Q9Z2V6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Hdac5Q9Z2V6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Hdac5Q9Z2V6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Hdac5Q9Z2V6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Hdac5Q9Z2V6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Hdac5Q9Z2V6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Hdac5Q9Z2V6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Hdac5Q9Z2V6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Hdac5Q9Z2V6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Hdac5Q9Z2V6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Hdac5Q9Z2V6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Hdac5Q9Z2V6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Hdac5Q9Z2V6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Hdac5Q9Z2V6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Hdac5Q9Z2V6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Hdac5Q9Z2V6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
Hdac5Q9Z2V6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Hdac5Q9Z2V6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Hdac5Q9Z2V6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Hdac5Q9Z2V6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Hdac5Q9Z2V6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Hdac5Q9Z2V6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Hdac5Q9Z2V6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Hdac5Q9Z2V6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Hdac5Q9Z2V6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Hdac5Q9Z2V6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Hdac5Q9Z2V6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Hdac5Q9Z2V6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Hdac5Q9Z2V6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Hdac5Q9Z2V6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Hdac5Q9Z2V6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Hdac5Q9Z2V6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Hdac5Q9Z2V6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Hdac5Q9Z2V6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hdac5Q9Z2V6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hdac5Q9Z2V6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hdac5Q9Z2V6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hdac5Q9Z2V6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hdac5Q9Z2V6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hdac5Q9Z2V6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hdac5Q9Z2V6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Hdac5Q9Z2V6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Hdac5Q9Z2V6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Hdac5Q9Z2V6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Hdac5Q9Z2V6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Hdac5Q9Z2V6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Hdac5Q9Z2V6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Hdac5Q9Z2V6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Hdac5Q9Z2V6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Hdac5Q9Z2V6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Hdac5Q9Z2V6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Hdac5Q9Z2V6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Hdac5Q9Z2V6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Hdac5Q9Z2V6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Hdac5Q9Z2V6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Hdac5Q9Z2V6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Hdac5Q9Z2V6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Hdac5Q9Z2V6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Hdac5Q9Z2V6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Hdac5Q9Z2V6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms