Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gipc1Q9Z0G0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gipc1Q9Z0G0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gipc1Q9Z0G0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gipc1Q9Z0G0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gipc1Q9Z0G0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gipc1Q9Z0G0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gipc1Q9Z0G0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gipc1Q9Z0G0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gipc1Q9Z0G0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gipc1Q9Z0G0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gipc1Q9Z0G0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gipc1Q9Z0G0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gipc1Q9Z0G0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gipc1Q9Z0G0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gipc1Q9Z0G0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gipc1Q9Z0G0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms