Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Snx1Q9WV80 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Snx1Q9WV80 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Snx1Q9WV80 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx1Q9WV80 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx1Q9WV80 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Snx1Q9WV80 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx1Q9WV80 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx1Q9WV80 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Snx1Q9WV80 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx1Q9WV80 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Snx1Q9WV80 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx1Q9WV80 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx1Q9WV80 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Snx1Q9WV80 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx1Q9WV80 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx1Q9WV80 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Snx1Q9WV80 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Snx1Q9WV80 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms