Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ArcQ9WV31 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ArcQ9WV31 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ArcQ9WV31 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ArcQ9WV31 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ArcQ9WV31 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ArcQ9WV31 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ArcQ9WV31 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ArcQ9WV31 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ArcQ9WV31 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ArcQ9WV31 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ArcQ9WV31 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ArcQ9WV31 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ArcQ9WV31 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ArcQ9WV31 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ArcQ9WV31 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ArcQ9WV31 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ArcQ9WV31 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ArcQ9WV31 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ArcQ9WV31 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ArcQ9WV31 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms