Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Scnn1bQ9WU38 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Scnn1bQ9WU38 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scnn1bQ9WU38 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scnn1bQ9WU38 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scnn1bQ9WU38 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scnn1bQ9WU38 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Scnn1bQ9WU38 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scnn1bQ9WU38 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Scnn1bQ9WU38 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scnn1bQ9WU38 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Scnn1bQ9WU38 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scnn1bQ9WU38 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scnn1bQ9WU38 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Scnn1bQ9WU38 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Scnn1bQ9WU38 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Scnn1bQ9WU38 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Scnn1bQ9WU38 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Scnn1bQ9WU38 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Scnn1bQ9WU38 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Scnn1bQ9WU38 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scnn1bQ9WU38 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scnn1bQ9WU38 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scnn1bQ9WU38 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Scnn1bQ9WU38 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms