Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn8aQ9WTU3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Scn8aQ9WTU3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Scn8aQ9WTU3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Scn8aQ9WTU3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scn8aQ9WTU3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scn8aQ9WTU3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms