Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdh13Q9WTR5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdh13Q9WTR5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdh13Q9WTR5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdh13Q9WTR5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdh13Q9WTR5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdh13Q9WTR5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms