Protein–RNA interactions for Protein: Q9R207

Nbn, Nibrin, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbnQ9R207 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NbnQ9R207 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NbnQ9R207 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NbnQ9R207 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NbnQ9R207 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NbnQ9R207 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NbnQ9R207 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NbnQ9R207 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NbnQ9R207 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NbnQ9R207 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NbnQ9R207 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NbnQ9R207 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NbnQ9R207 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NbnQ9R207 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NbnQ9R207 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NbnQ9R207 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NbnQ9R207 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NbnQ9R207 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NbnQ9R207 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NbnQ9R207 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms